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Los humedales no son ecosistemas aislados; para preservar el agua y la biodiversidad se requiere la conectividad ecológica con otras áreas de importancia para la conservación como páramos, cerros, ríos, quebradas y bosques. Desde la perspectiva del Jardín Botánico de Bogotá, la restauración ecológica de los humedales sólo es posible a través del ordenamiento territorial sostenible de las cuencas hidrográficas de la ciudad: Tunjuelo, Fucha, Salitre y Torca, que su vez aportan sus aguas al río Bogotá y se encuentran afectas por las problemáticas propias del crecimiento urbano del Distrito Capital.