Misión
Contribuir al bienestar de Bogotá mediante soluciones desde la ciencia, educación, la conservación de la biodiversidad, y la conexión con la naturaleza desde un espacio singular.

Visión
Un Jardín Botánico que impulsa de forma integrada y visible la transformación de Bogotá en un sistema vivo, conectado y resiliente, liderando soluciones para el bienestar de los ciudadanos.

Estrategias
- Construcción de orgullo ciudadano a través de una identidad que conecte.
- Transformación de la experiencia de visita.
- Desarrollo de soluciones desde la ciencia, la tecnología e innovación, para los retos ambientales de Bogotá – región.
-
Mejorar la capacidad financiera, administrativa y operacional.
-
Articulación interna y cohesión organizacional.

Objetivos Estratégicos
1.Consolidar al Jardín Botánico José Celestino Mutis como motivo de orgullo para la ciudad y como una institución cercana a la comunidad, orientada a promover el bienestar físico, emocional y ambiental, fomentar la cultura y la educación para la sostenibilidad, y fortalecer la apropiación y el sentido de pertenencia frente al patrimonio natural.
2. Fortalecer al Jardín Botánico José Celestino Mutis como un destino que ofrezca experiencias enriquecedoras y de alto impacto que potencien la conexión emocional con la naturaleza, promuevan el aprendizaje vivencial y eleven el compromiso con la conservación y el cuidado ambiental.

3. Posicionar al Jardín Botánico José Celestino Mutis como referente en ciencia, tecnología e innovación ambiental, mediante la articulación interna y la cooperación con aliados locales, nacionales e internacionales, con el fin de contribuir a la planificación, el incremento, el mantenimiento y la mejora de las coberturas vegetales en el Distrito Capital y la ciudad-región, así como a la conservación y gestión de la biodiversidad, la conectividad ecológica y la provisión de servicios ambientales en Bogotá.
4. Fortalecer la capacidad financiera, administrativa y operativa de la entidad, asegurando la sostenibilidad a través de la diversificación responsable de las fuentes de ingreso y la consolidación de un equipo humano comprometido y calificado, así como una infraestructura física adecuada, con el objetivo de garantizar su misionalidad y brindar servicios eficientes y transparentes.
5. Consolidar la articulación interna y la cohesión organizacional mediante la adopción de metas e indicadores claros y medibles, el seguimiento sistemático de la gestión y el fortalecimiento de la cultura institucional orientada al control, la mejora continua y el desarrollo del talento humano, en el marco del Modelo Integrado de Planeación y Gestión (MIPG). Así, se asegurará la ejecución efectiva del Plan Estratégico y la generación de valor público.
Funciones
El Jardín Botánico de Bogotá José Celestino Mutis se constituyó mediante el Acuerdo 39 de 1.992, como establecimiento público del sector descentralizado, con personería jurídica, autonomía y patrimonio propio. Actualmente, junto con la Secretaría Distrital de Ambiente, el Instituto Distrital de Gestión de Riesgos y Cambio Climático – IDIGER, y el Instituto de Protección y Bienestar Animal – IDPYBA conforman el sector ambiente del Distrito.
Por medio del decreto 040 de 1993 se precisa la naturaleza jurídica, la estructura orgánica, las fuentes de financiación y las funciones del Jardín Botánico José Celestino Mutis.
Mediante los acuerdos 001 de abril 17 de 2001, 11 de diciembre 20 de 2001, 002 de marzo 17 de 2006, 02 de marzo 14 de 2007 y 05 de agosto 18 de 2022 se modifica la estructura organizacional del Jardín Botánico José Celestino Mutis, la cual se conforma por la Junta Directiva: Dirección, Oficina de Control Interno, Oficina Asesora de Planeación, Oficina Jurídica, Secretaría General, Oficina de Control Disciplinario Interno, Subdirección Científica, Subdirección Técnica Operativa, Oficina de Arborización y Subdirección Educativa y Cultural.

- Adelantar investigaciones científicas para ampliar el conocimiento de la flora, de la biología de
las plantas del medio ambiente donde crecen, y de la fauna autóctona de la región. - Desarrollar programas de educación para personas de diferentes edades, estudios o intereses, sobre
botánica, ecología y medio ambiente. - Promover mediante programas educativos y recreativos la conservación de los recursos naturales y
apoyar el Plan de Gestión Ambiental del Distrito. - Propender por el incremento de los estudios botánicos, mediante la colaboración con los demás
Jardines Botánicos del país y del exterior y con otros centros científicos y educativos similares. - Mantener y preservar en sus predios, especies de plantas en vía o en peligro de extinción.
- Mantener refugios de flora y fauna en áreas cubiertas por la vegetación natural, destinados a
proteger aquellas especies que no puedan prosperar bajo condiciones climáticas del Jardín Botánico o
bajo invernaderos. - Estimular en el público el amor por las plantas, mediante el desarrollo de programas recreativos y
la entrega de información adecuada sobre ellas. - Suministrar material de propagación de especies de plantas que se quieran probar en condiciones
variadas de clima y suelo. - Divulgar los resultados de las investigaciones sobre las plantas y su vida, en forma asequible a
todos los niveles de educación, desde el infantil hasta el profesional especializado, teniendo como
meta la adquisición y diseminación del conocimiento botánico. - Colaborar con las demás entidades del Distrito Capital, particularmente con la Universidad Distrital
Francisco José de Caldas, con autoridades locales y con el sector privado, en programas de
arborización y ornamentación de la ciudad.